Nie korzystasz w ogóle z autobusów/tramwajów/metra itd... Twoje miasto ma ponad 40 tysięcy mieszkańców! Nic dziwnego, że masz takie korki - cały ruch zrzucony został na komunikację samochodową. Zainwestuj koniecznie w rozwój sieci transportu publicznego i połącz ze sobą te dzielnice większa ilością dróg (ale tych normalnych, nie kilkupasmowych).
Pamiętam, że kiedyś twórcy na jakimś czacie tłumaczyli, że miasto w Cities Skylines mające 10 tysięcy mieszkańców, odpowiada mniej więcej 100-tysięcznemu miastu w rzeczywistości, jesli chodzi o ruch, także w twoim przypadku mamy 400 tysięczne duże miasto bez komunikacji miejskiej :P

Dodatkowo proponowałbym zbudowanie rond w miejsca najbardziej obleganych skrzyżowań - najlepiej stawiać je wykorzystując do tego drogę typu autostrada - bo wówczas samochody najszybciej będą jeździć

Skorzystaj z komunikacji
a) do stref przemysłowych pociągnij pociąg i kilka stacji cargo
b) w mieście wiadomo, komunikacja miejska, może być i kolejowa

Jak nie chcesz korzystać z komunikacji (miasto nieduże więc jeszcze nie jest konieczna) to popracuj nad siatka dróg, na początek WYWAL te autostrady które bardziej Ci miasto rozdzielają zamiast łączyć (szczególnie tą pionową oraz tą poziomą z w dolnej części, z lewej)

usunąć tą autostrade gdzie jest zacznaczona czarnym ?

Dokładnie tak, zamiast tej pierwszej daj pojedyńczą sześciopasmówkę natomiast tą drugą wywal w zamian tworząc połączenia Pagórków Zaliborza z tym co powyżej oraz dalej z Dzielnicą Bronowice - po 2-3 sześciopasmówki w zupełności powinny wystarczyć.
Aha - jako że Pagórki Żoliborza to przemysł zostaw im połączenie z autostradą ale prościej - od razu w lewo prosto do zjazdu.
Tam powyżej - chyba była druga dzielnica przemysłowa - im też daj db połączenie z autostradą.

Page UP/Down działa również w przypadku metra, aby linie się nie krzyżowały jeśli tego nie chcemy

Straszny bałagan w tych autostradach. Widze że ze środka dzielnicy Pagórki Żoliborz można wyjechać tylko jedną ulicą, która się korkuje. Gdyby był drugi wyjazd myśle że polepszyło by troche sytuację. Dodatkowo autostrady są źle podłączone. Na obrazku to pokazałem. Samochody mogą jechać tylko w jednym kierunku. Troche to dziwne co nie.